Strike Buster Prototype дает игрокам возможность отправиться в ретро-перестрелки, уничтожая толпы соперников. Игра выполнена в жанре аркадного скролл-шутера, где присутствуют элементы роуглайт. Пользователи будут пробираться через разнообразные уровни и локации, постепенно улучшая своего героя. Придется собирать древние реликвии, вступать в схватки с опасными монстрами и заниматься модернизацией вооружения для устранения более сильных врагов на локациях.

В Старйк Бустер Прототип используется анимешная стилизация персонажей, что будут участвовать в кат-сценах и пиксельная рисовка во время битв в космическом пространстве. Геймеры получают возможность проворачивать комбинации из различных навыков и приемов, чтобы наносить урон по своим оппонентам. Предстоит отслеживать за тремя основными параметрами: количество здоровья, энергии и накопление опыта (необходимо для прокачки).

Во время прохождения одиночной кампании, пользователям предстоит переключать разные наборы пушек и снаряжения, что представляет собой броню для протагонистки. Героиня сможет свободно передвигаться по представленному пространству, летая и уклоняясь от врагов. Геймерам придется построить собственную тактику для победы над боссами и рядовыми соперниками, применяя особенности реликвий и древних артефактов, что повышают защитные или атакующие способности.