Maji de Watashi ni Koishinasai! S - продолжение визуальной новеллы в аниме-стилистике. Игра относится к одноименной серии визуальных романов Люби меня, серьёзно! Действия разворачиваются в городе под названием Каваками. Этот городок славится своим самурайским прошлым и чтит наследие предков. Жители Каваками очень ценят дух соперничества и борьбы.

Сореновательній дух проявляется во всем, даже в начальных классах школы, не говоря уже про спортивные состязания. Древние боевые искусства введены в школьную программу. Maji de Watashi ni Koishinasai! S рассказывает про героев, которые предпочитают решать вопросы силой, а не навыками или знаниями. Тем более последнее не очень в почете у местного населения. Главный герой Ямато Наоэ не выделяется особыми навыками борьбы, что немного делает его аутсайдером в своей школе.

Зато Наоэ проявляет талант в учебе и знаниях. Протагонист учится на втором курсе Академии Каваками и постоянно проводит время со своими лучшими друзьями: 2 парнями и 3 девушками. На удивление, их компания очень дружна и несмотря на то, что герой не силач и не особо любит вступать в конфликты. Герои предпочитают свою секретную базу обычным тусовкам с однокурсниками. Но все меняется внутри группы, когда к ним присоединяются две новых девушки…