Продолжатель оригинальной части Bionic Heart 2 переносит пользователей в технологичный мир, где человечество находится в альтернативном будущем. Игра выполнена в жанре визуальной новеллы, погружающей в атмосферу научной фантастики. Главными персонажами выступают Том, Люк, Таня и Тина. После побега на Марс, компания авантюристов ввязывается в новые приключения и сталкивается с неприятностями космического характера, происходящими на колониальной станции.

Сюжетная линия в Bionic Heart 2 развивается за счет действий игрока, которые предстоит применять в процессе прохождения. Геймеры будут наблюдать за происходящими событиями и оказывать влияние на историю. Получится посмотреть на мир с точек зрения четырех героев, поочередно управляя каждым из протагонистов. Поочередно продвигаясь за одного из персонажей, получится разобраться в личных проблемах и характерах приключенцев, отправившихся на покорение новой планеты. Игра наполнена романтикой и позволяет пользователям налаживать дружеские или любовные взаимосвязи между ребятами.

Центральными фигурами в сюжете выступают:

• Люк. Парень, который не может перестать думать о своей возлюбленной и страдает от этого.
  
• Том. Молодой человек, испытывающий неприкрытые чувства к Хелен.
  
• Таня. Кибернетический дроид, желающий сразиться с коварным злодеем Ричардом.
  
• Тина. Честный полицейский, что испытывает подозрения к Нанотех и желает провести частное расследование в корпорации.