Meteor Pendulum Heart представляет собой визуальную новеллу, рассчитанную на взрослую аудиторию пользователей из-за сцен эротического характера. В альтернативном будущем, человечество находится на стадии покорения космоса и активно перемещается между звездными пространствами. Главный герой по имени Уми был обычным студентом, оказавшимся случайно втянутым в галактический конфликт. Масштабные проблемы сталкивают протагониста с девушкой по имени Алиса, сотрудницей специальной космической полиции. В процессе совместных путешествий, персонажи начнут сближаться и лучше узнавать себя.

Пользователям в Meteor Pendulum Heart придется раскрывать тайны прошлой жизни юноши, способного с полного неудачника, превратиться в настоящего спасителя вселенной. Герои столкнутся с опасной угрозой в лице Дона Докгара, мечтающего захватить власть в мире и стать полноправным правителем галактики. Полицейские будут оказывать сопротивление преступной деятельности опасного противника, чтобы ослабить его влияние на мирных обитателей. Алиса будет поддерживать паренька, обучая его многим умениям, а также проявляя романтический интерес к его персоне. В процессе совместных путешествий, ребята познакомятся с другими девчонками, а геймеры смогут определиться с дамой сердца, развивая один из доступных любовных сценариев. В игре присутствует система выборов, помогающая предпринимать действия за персонажей и оказывать влияние на построение нелинейной истории про отважных авантюристов.