Malice - это игра-платформер, в которой игроки управляют титульным персонажем, рыжеволосой богиней, выполняющей миссию по победе над злым собачьим богом. С помощью Металлического Хранителя, гигантского существа, похожего на часы, Малис должна собрать 8 логических ключей, разбросанных по разным мирам, чтобы найти своего врага. Игра начинается с того, что герой терпит поражение от Собачьего Бога, который забирает ее жизнь. Однако Смерть, правитель подземного мира, считает протагонист непригодной для своих владений и отправляет ее обратно в мир живых. Там она встречает Металлического Хранителя, который раскрывает план Собачьего Бога по уничтожению Вселенной и просит Малис помочь остановить его.

Вооружившись гигантской дубиной и опираясь на знания Хранителя Металла, грой отправляется в путешествие по двадцати различным мирам. Каждый из них ставит перед протагонистом задачи и препятствия, которые ей предстоит преодолеть. На протяжении всего путешествия она встречает различных персонажей, включая загадочную Смерть, которая появляется всякий раз, когда Малис падает в бою, и озорное Дерево Сирен, сомневающееся в способности добиться успеха.

По мере прохождения персонаж улучшает свое оружие и открывает бонусные возможности, предлагаемые Металлическим Стражем. Конечная цель - собрать все восемь логических ключей, что позволит Хранителю металла отследить местоположение артефакта и подготовить почву для финального противостояния. Движимая жаждой мести и судьбой вселенной, которая висит на волоске, Малис должна противостоять любым опасностям, чтобы достичь своей цели.