В IS - Internal Section юзерам отводится роль одинокого оперативника, выполняющего сверхсекретное задание в глубине разросшегося укрепленного комплекса. Их цель - проникнуть, нейтрализовать его и сбежать. Комплекс разделен на отдельные секции, каждая из которых охраняется все более сложными мерами безопасности и роботами-защитниками. Игроки пробираются через вентиляционные отверстия, ползут по тоннелям для технического обслуживания, прокладывают путь через лазерные решетки, избегая при этом обнаружения и уничтожая всех врагов, которые встают на их пути.

Тут особое внимание уделяется стратегическому планированию и решению проблем. Каждый участок представляет собой уникальную задачу, заставляя игроков менять тактику на ходу. Стоит ли идти напролом или лучше действовать скрытно? Беречь ли патроны и полагаться на опасные факторы окружающей среды, чтобы уничтожить врагов, или вооружиться мощным оружием для прямого нападения? Выбор за ними, и последствия реальны. Успех миссии зависит от тщательного управления инвентарем.

Патроны, аптечки и приспособления для оружия разбросаны по всему комплексу, их нужно собирать и использовать стратегически. Один неверный выстрел или неудачный маневр могут сделать игрока уязвимым и незащищенным, что заставит его заново проходить участок. IS - Internal Section предлагает испытание рефлексов и точности. Уклонение от лучей часовых, обезвреживание бесконтактных мин, бесшумные захваты - все это требует быстрого мышления и твердых рук. Один неверный шаг может спровоцировать тревогу, вызвать волну подкреплений и поставить под угрозу всю миссию.