Lone Fungus переносит пользователей в фэнтезийный мир, где предстоит взять под управление последнего выжившего гриба-гуманоида. Игра представляет собой классическую метроидванию, где необходимо изучать открытый мир, прокачивать персонажа, сталкиваться с опасностями и монстрами, а также открывать секреты вселенной, созданной грибами. У юзеров выйдет посетить 8 уникальных регионов, которые можно свободно исследовать. На локациях получится отыскать реликвии, эмблемы и улучшения, что повышают здоровье протагониста.

Герой в Лон Фангус будет сталкиваться с ландшафтными препятствиями и монстрами, сражаясь при помощи меча. Выйдет создавать заклинания, творчески разбираясь с проблемами в бою. В игре присутствует 4 уровня сложности, а геймплейные механики схваток выполнены в стиле платформера Celeste. В бою можно парировать атаки, отбивать летящие снаряды во врагов и т.п. Обнаруженные на карте "Эмблемы" и "Реликвии"(более 35 разновидностей) позволят создавать уникальные билды, основанные на боевых способностях от надетых предметов: исцеление, дополнительная защита, усиление атаки, вихрь для отражения снарядов и т.д.

В процессе прохождения, пользователи столкнуться с 21 боссом во время изучения темных данжей. Каждый главарь обладает собственной тактикой и несколькими атакующими фазами. Для тренировки перед сражением, игроки смогут опробовать свои силы на обучающих уровнях. Также выйдет протестировать Assist-Mode (6 гибких настроек для геймплея), Platforming Pause (тактическая пауза во время прохождения), Magic Platforms (упрощение испытаний с прыжками), Worldmap Hints (подсказки на карте мира), Stronger Sword (повышает урон от мечей), Infinite MP (бесконечные заклинания) и Invincibility (бессмертие).