В The First Tree тесно переплетаются две сюжетные линии. Игра представляет собой квест, в котором лис ищет свое семейство, и мальчик желает отыскать своего папу. В процессе развития сюжета дороги этих двух персонажей пересекаются, приобретая неожиданный финал. Прохождение осуществляется за лису, которой удастся понять что такое смерть, лишь приблизившись к источнику жизни. Здесь существование всего живого на земле связанно с мировым древом.

Первое дерево обладает платформенным геймплеем и головоломками. В симуляторе ходьбы лисица займется исследованием леса. Она пытается найти своих детенышей, и в процессе ей предстоит немало бегать, собирать огоньки, прыгать и даже копать. Действо сопровождается диалогами между мужчиной Джозефом и женщиной Рэйчел, повествующими об их прошлом. Джозеф рассказывает жене о том, как потерял отца на Аляске и пытался его найти, за что над ним издевались в школе и парень связался с плохой компанией. Он вспомнил хорошие и плохие события, из которых сложилась его жизнь.

Эти две истории происходят параллельно. Протагонист будет находить предметы, связанные определенным образом с парнем, а препятствия на его пути будут аналогичными с историями мужа о его проблемах. Игра разделена на пять уровней с отдельным окружением: заснеженными снежными вершинами, густым лесом, зелеными полями. Финал трагичен - герой находит своих детей мертвыми, но этот рассказ оказался просто сном Джозефа, в образе которого оказывается игрок. Мужчина в доме один, куда делась жена с ребенком - неясно, но протагонист отправляется в лес к мировому древу.