Space Pirates And Zombies 2 продолжает события первой части. Галактика еле пережила зомби-апокалипсис. Юзер и 200 других капитанов (под контролем ИИ) будут выживать в мире, где инфраструктура уничтожена, а остатки уцелевших пытаются добыть дефицитное топливо и другие ресурсы. Эльза Янг вместе с командой все ещё путешествует, занимаясь ликвидацией последних очагов заражения.

В сиквеле SPAZ была убрана "умная" пауза. Геймер теперь управляет одним флагманом. Можно создать до 4 вспомогательных судов и отдавать приказы лететь в нужную точку. При этом союзники будут сами решать, что делать по прибытии. Традиционные квесты, включая побочные, остались в оригинале. Игрок будет развлекать себя самостоятельно. Главное отличие Space Pirates And Zombies 2 от предшественника заключается в боевке. Раньше пользователь сражался с видом сверху. Теперь же схватки происходят на отдельных аренах в 3D и только в реальном времени. В космосе игрок перемещается по секторам с помощью глобальной карты. На ней он сталкивается со случайными событиями и решает, как поступать в разных ситуациях.

Система конструирования кораблей была улучшена. Все модули генерируются случайным образом. Появилась возможность отстрелить у противника часть и прикрутить её к своему звездолету прямо в ходе поединка. Создатели позволили юзеру самостоятельно выбирать форму своего транспорта. Каждый вставленный в летающий агрегат элемент обладает своими собственными параметрами и бонусами к характеристикам – прямо как экипировка героев в ролевых играх. Взаимодействие с фракциями было переработано. Каждое сражение отныне влияет на отношение к пользователю той или иной группировки. Еще тут есть прокачка. При повышении уровня разрешают улучшить корпус, щиты, броню и т. п. А с ростом опыта открывается доступ к новым видам блоков и большему их количеству.