The Inner Sea – ролевое приключение в открытом мире, действие которого происходит в 17 веке на гигантском архипелаге, куда входят множество островов с уникальными локациями. Геймеру достаётся в управление громадный парусный фрегат, который необходимо улучшать на протяжении всей однопользовательской кампании. Помимо участия в морских сражениях против превосходящих сил соперника, игрок занимается торговлей, сбором улучшений для корабля, наймом верного коллектива, готового на всё ради того, чтобы выйти из бой целым и невредимым.

Сюжетная линия стартует с показа путешествия главного героя, взявшегося за поручение от влиятельных людей. Попав в мощнейший шторм, протагонист чудом выживает, когда корабль и экипаж получили серьёзных урон. Игра предоставляет несколько путей развития для игрока, который волен стать злодеем и грабить приморские территории, или попробовать себя в роли защитника мирного населения. Нелинейность влияет на окончание не только определённого задания, но и на финальные сцены.

Особенностью геймплея становится тот факт, что перед каждым стартом новой игры, архипелаг процедурно рандомно генерируется с помощью специально обученного искусственного интеллекта. Это позволяет говорить о возможности перепройти проект на другие выборы и ради изучения отличающихся территорий. Помимо сюжетных заданий, на карте располагаются побочные спецоперации, что помогают собирать улучшения и деньги для дальнейшего приобретения недостающих материалов.