BioForge необычно обыгрывает стандартный сценарный ход с амнезией. Протагонист просыпается в незнакомом месте и ничего не помнит. Но вскоре он понимает, что находится на научной базе. Также герой быстро осознает, что кто-то сделал из него киборга с торчащими кусками плоти. Чуть позже выясняется, что исследовательский комплекс расположен на планете Дедал, а управляет этим учреждением секта религиозных фанатиков Мондитов. Главный персонаж по воли случая получает свободу и отправляется искать ответы. Также он хочет поквитаться с теми, кто его изуродовал.

BioForge сочетает в себе несколько жанров: beat 'em up, action, adventure. Герой-киборг может наносить противникам удары кулаками, ногами, головой. Также он способен отбегать, перекатываться, использовать подручные предметы. Кроме рукопашного боя в игре есть перестрелки с применением бластеров и других пушек. Атмосфера и сеттинг проекта сочетают в себе киберпанк, хоррор и научную фантастику. Присутствует кровь и мясо.

Помимо сражений тут надо решать загадки, применяя найденные предметы в нужных местах и в правильной последовательности. Персонаж перемещается между экранами. В каждом из них фиксированная камера показывает разные ракурсы. Детали сюжета и лора раскрываются в многочисленных дневниках и записках, разбросанных по станции. Почти всё её обитатели выжили из ума и стали враждебно себя вести. Однако среди них встретятся и пара дружественно настроенных NPC, с которыми можно поболтать.