Super Sanctum TD относится к жанру Tower Defense. Инди-проект использует двухмерную пиксельную графику и изометрический вид. Игра является ответвлением в серии шутеров от первого лица. События происходят в той же вселенной.

Цель Super Sanctum TD состоит в том, чтобы не дать пришельцем добраться до ядра. Для этого надо строить лабиринты, и расставлять башни (турели, огнеметы, лазерные пушки). Пока недруги будут блуждать в коридорах, их начнут расстреливать оборонительные сооружения, которые позволяют прокачивать и настраивать. Можно указывать, чтобы конкретное здание атаковало врага с самым высоким запасом здоровья. Кампания состоит из 12 карт. Их можно проходить на двух типах сложности – нормальном и тяжелом. Также присутствует режим выживания, где надо продержаться как можно дольше против бесконечных толп недругов.

У тайтла есть пара своих особенностей. Во-первых, здесь пользователь может использовать разные способности. Например: отталкивать противников, замораживать их, призывать черные дыры, сбрасывать бомбы и всё в таком духе. На миссию разрешают взять максимум 4 навыка. Здания тоже надо выбирать перед началом задания. Во-вторых, здесь есть прокачка профиля. По мере прохождения геймер зарабатывает опыт. При получении нового уровня ему выдают очки. Их можно потратить на улучшение зданий и самых способностей. Все постройки и магические заклинания открываются постепенно.