Gateways – это платформер-метроидвания с элементами головоломки и видом сбоку. Играем за седого ученого в белом халате. Герой изначально может только бегать и прыгать. Если несколько раз подряд прыгнуть на голову врагу, то он исчезнет. Однако не всех противников тут разрешают уничтожать таким способом. У протагониста присутствует запас жизней в форме 3 колб. Если они иссякнут, то его возродят на ближайшей контрольной точке (на ней же сохраняется игровой прогресс). В этом проекте есть кровь.

У Gateways частично открытый мир. Карту можно исследовать свободно без экранов загрузки. Часто протагонист будет натыкаться на временно непреодолимые препятствия. В такие моменты, чтобы пройти дальше, нужно отправиться в другие места и отыскать там улучшения, что расширят список действий главного персонажа. По локациям разбросаны энергетические сферы. Это аналог валюты. Только здесь за неё покупается не новая экипировка или апгрейды на неё, а подсказки к решению загадок.

От других подобных тайтл инди-проект отличается наличием разнообразных возможностей. По мере сбора паверапов научный сотрудник научится создавать порталы практически на любой поверхности, призывать собственных двойников, менять свой размер, путешествовать во времени, ходить по стенам и потолкам. На применении этих способностей в правильном порядке здесь строится большинство пазлов и сражений. Сами события происходят в большой лаборатории.