В Other Submarine главный герой оказался закрыт на борту субмарины на глубине нескольких десятков метров. Он инженер, и для того, чтобы выбраться, ему необходимо возобновить подачу топлива, что в свою очередь приведет в действие само судно. Здесь есть и другие члены экипажа, но они явно не настроены дружелюбно к персонажу. Поэтому, от них лучше держаться по дальше.

Для выполнения основной задачи необходимо справиться с побочными квестами. Это головоломки, включающие в себя настройку генераторов, перенаправление клапанов на панели (нужно развернуть фрагменты таким образом, чтобы цепь замкнулась). Большая часть территории не освещается, поэтому придется активно орудовать фонариком. Продвигаясь по уровням на лодке, входы в каюты и помещения будут подсвечиваться по-разному. Компьютеры, рычаги и прочие элементы окружения также имеют подсветку, что помогает лучше ориентироваться в пространстве. Что касается пассажиров, то они не будут подавать признаков активности, если их самих не трогать. Только если геймер подойдет слишком близко, антагонисты Other Submarine нападут. Но, если все сделать гладко, можно обойтись без усложнений игрового процесса, ведь оружия нет, и защищаться попросту нечем.