В центре Messiah оказывается ангел по имени Боб, получивший приказ от самого Бога, создателя вселенной. Главному герою понадобится очистить гнилостный мир будущего. Сила одержимости позволяет ему попадать в душу любого живого существа, взаимодействуя с их душами. Контролируя невидимую сущность, Боб способен направлять управляемое животное или человека, основываясь на собственных целях.

Перед великой миссией протагонист был обычным ангелом рабочего класса. Бог заметил его потенциал и поручил выполнить трудную и грязную задачу. С помощью необычной способности, пользователь может контролировать тело любого человека, применять их вооружение и голые руки. Каждый человеческий персонаж способен душить, калечить, пронзать острыми предметами, стрелять и сжигать территории дотла. Скрываясь внутри невидимых душ, Боб использует тела в качестве брони.

В мире Мессии геймер способен управлять любым персонажем на карте. Окружение, оружие, экипировка и здания выполнены в стиле киберпанка. Мозг и мускулы врагов помогут сразиться с дьяволом, терроризирующим человечество. Главный герой может умереть, если будет часто погибать, контролируя живых существ. Его ангельская сила постепенно уходит при получении урона. Каждый юнит имеет разную экипировку, вооружение и характеристику.