Геймплей URU: Complete Chronicles сосредоточен на исследовании разнообразных уголков планеты Д-ни. Таинственные места включают десятки головоломок и историю, написанную прежними обитателями. Главный герой занимается поиском Книг-порталов, позволяющих открывать двери в новые области загадочного мира. По мере продвижения он восстанавливает энергоустановки и различные механизмы.

Центральный персонаж представлен в виде некого механика-археолога, пытающегося понять правду исчезнувшей цивилизации. Планета тщательно проработана разработчиками. При желании, пользователь сможет изучить часть языка вымершей расы, изучить алфавит, систему счисления, бывшее искусство, традиции, обряды и истории, связанные с давними правителями. Перед прохождением игрок создаст аватара, собственноручно настроив его внешность из таких параметров: возраст, телосложение, пол, одежда, прическа, цвет кожи и другое. Доступна смена вида между первым и третьим лицом.

Сюжет URU раскрывает историю ранних событий, произошедших в серии игр Myst. В прохождении встретятся десятки разных задач, нацеленных на взаимодействие с окружением и логическими последовательными действиями. Персонаж не способен умереть или вызвать необратимые действия. Сохранение происходит автоматическим образом при завершении сессии.