Ikari Shinji Ikusei Keikaku повествует про события, происходящие в сеттинге анимешного тайтла Евангелион. Пользователям предстоит заниматься развитием главного героя, чтобы добиться в будущем успехов в боевых стычках. Вселенная игры погружает в научную-фантастику, где человечество добилось высокого технологичного прорыва и теперь способно создавать для защиты могущественных роботов, которыми должны управлять элитные и специально натренированные солдаты. Подготовка начинается с самого детства, и задачей игрока становится помощь в тренировках протагониста.

В процессе прохождения Проект Воспитания Икари Синдзи, геймеры будут прорабатывать стратегии по улучшению характеристик героя и расписывать план для работы. Игра выполнена в виде визуальной новеллы, совмещающей элементы интерактивного симулятора. Придется активно взаимодействовать с доступными опциями и командами, что направляют действия молодого человека. Юноша будет попадать в разнообразные трудные ситуации, которые должны приготовить его к настоящей и суровой взрослой жизни.

Отправляясь на работу с будущим бойцом меха, юзерам придется:

• Продумывать план для тренировок, чтобы повышать показатели у протагониста.
  
• Общаться с другими наставниками, получая новые знания о вселенной и боевых приемах.
  
• Разбираться в управлении сложными механическими роботами.
  
• Сближаться с другими персонажами, налаживая дружеские или романтические отношения.