Динамические сражения в Desert Thunder погружают игроков в атмосферу затяжных войн, где предстоит брать под управление тяжелую военную технику. Отправляясь в бой, придется проходить через множество испытаний и выполнять боевые задачи, которое выдает командование. Игра выполнена в форме классической стратегии в реальном времени, позволяющей прочувствовать эпические битвы между танками и другими видами бронированных машин, участвующих в опасных операциях. Главной задачей для протагониста становится решение проблем, вызванных деятельностью коварных террористов, что захватили под свой контроль мирную ближневосточную страну. Необходимо в одиночку продвигаться к поставленной цели, уничтожая сопротивляющихся противников.

Погружаясь в мир Дэсерт Тандер, игрокам приходится:

• Проходить одиночную сюжетную кампанию, где придется выполнять поочередно усложняющиеся задания.
  
• Участвовать в баталиях, происходящих в пустынных территориях, чтобы выполнить ответственную операцию под названием "Гром в пустыне".
  
• Прорываться через городские и промышленные районы, находящиеся в песках восточных государств.
  
• Опробовать в битвах экспериментальный образец танка модели Abrams M1A6 Advanced, переносящий на борту большое разнообразие вооружения, защищенного плотной и толстой броней.
  
• Координировать действия военной техники, чтобы справиться с опасностями и уничтожить террористическую группировку.