Визуальный рассказ Narcissu - side 2nd повествует про приключения девчонки по имени Химэко, что раньше была волонтером и сейчас подрабатывает в больнице, помогая пациентам на седьмом этаже корпуса. Игра представляет собой начало истории, что показана в оригинальной новелле, перенося действия на шесть лет назад. В процессе прохождения, геймеры будут наблюдать за действиями героини, что повстречает Сэцуми в одной из палат. Ребята познакомятся и смогут наладить дружеские отношения во время общения. Девушка будет помогать больному пациенту справиться с амбулаторным лечением, оказывая моральную поддержку и проявляя некоторую симпатию.

Геймеры в Нарциссу - сайд 2nd будут смотреть за построением взаимоотношений между героями, где не получится оказывать влияние на происходящие события в процессе прохождения. Игра сделана в форме кинетического повествования, где необходимо переключаться между экранами с иллюстрациями сцен, нарисованных в анимешной стилистике. Геймеры будут переключать диалоги между протагонистами, читая новеллу и узнавая подробности из рутины жизнерадостной и веселой девчушки, что старается помочь болеющим людям, находящимся в больничных палатах. Девушка осваивает разнообразные умения, повышая квалификацию и знания в сфере медицины, параллельно стараясь наладить проблемы со своей личной жизнью, беседуя с милым юношей Сэцуми.