Trinoline Genesis представляет собой визуальную новеллу, в которой предстоит узнать историю парня по имени Шун. Герой в прошлом потерял родную сестру Широне Нанами, которая утонула в море. С того времени, парень поклялся прожить вместо неё и стать достойным человеком, стараясь таким образом компенсировать потерю. Пользователи будут наблюдать за развитием интерактивного рассказа, где приходится осуществлять выборы и оказывать влияние на сюжетную линию. Юзеры будут перелистывать иллюстрации с изображениями персонажей, а также читать диалоги и мысли протагониста в текстовом окне.

Погружаясь в Триолайн Генезис, геймерам приходится отслеживать за жизнью героя, что обучается в старшей школе и занимается привычными для ученика делами. В один день, он встречает точную копию его сестры и узнает, что это дроид, которого зовут "ТРИНО". С этого момента придется разбираться с загадочным появлением существа, что играет на фортепиано и выглядит так же, как и Широне. Шун будет заботиться о странной девушке, стараясь помочь ей в социализации с другими людьми.

Погружаясь в сюжет новеллы, игрокам приходится:

• Познакомиться с другими персонажами, такими как: Сара, Аяки, Ханако и Юри.
  
• Выяснить тайну девчонки-дроида, что появляется в жизни протагониста.
  
• Совершать выборы от лица героя, оказывающие влияние на историю.
  
• Добиться одной из концовок, а также открыть несколько арок повествования.