В Crystal Key 2: The Far Realm авторы продолжают развивать историю, начавшуюся ранее в первой части серии. Здесь, геймеры все также находятся в знакомой для них планетарной системе. Только на этот раз роль главного героя достается молодому парню по имени Колл - сыну протагониста прошлой части. Среди населения начинает распространяться странная зараза, в буквальном смысле лишающая людей воли. Они становятся чем-то средним между зомби и роботами. Чтобы положить конец этому бедствию и вернуть всем жителям их привычный вид, персонажу предстоит отправиться в довольно продолжительное приключение. И после короткого вступления, которое зачитывается от лица главного героя, начинается основная стадия проекта.

По части геймплея Crystal Key II: The Far Realm представляет собой классический квест, где все построено на кликабельной системе взаимодействия. Это значит, что двигаться, общаться со сторонними юнитами, взаимодействовать с объектами и совершать прочие действия можно только с помощью курсора мыши. Так, кликнув на пространство перед собой, игрок сразу же продвинется на несколько метров вперед. Но при этом здесь нет привычной для жанра сухой и статичной картинки, когда в поле зрения геймера ничего не происходит. Наоборот, вокруг довольно много движения, и все выглядит оживленно. Более того, перемещения на лифтах или проход через двери сопровождается не просто сменой кадров, а полноценной анимацией. Во время диалогов мимика персонажей оживленная, и все движения лица можно отчетливо разглядеть. В процессе общения можно не только получить больше информации о мире и вселенной в целом, но и раздобыть важные сведения для решения головоломок.