Геймерам в Front Mission 3 предстоит взять под управление героев, что используют для путешествий "Ванзеров" (механизированных роботов). Игра представляет собой стратегию с пошаговой системой боя, где приходится заниматься проработкой тактики и прокачкой своих персонажей. Юзеры соберут отряд из Мехов, которых получится настраивать желаемым образом. Выйдет менять составляющие корпуса, приобретать и устанавливать детали, а также экипировать вооружение и предметы, что будут оказывать поддержку для партии в битве. Сражения будут происходить на специальном поле, что разделено на клетки.

Погружаясь в мир Фронт Миссион 3, юзеров ожидает:

• Возможность выставить в бой до 4-х протагонистов, что будут отличаться уникальными боевыми способностями.
  
• Прокачка и модернизация "Ванзеров", приобретая новые виды пушек и защитные элементы для корпуса.
  
• Пошаговые стычки, где необходимо отдавать приказы для своих юнитов и координировать их действия.

Главной задачей для игроков в каждой миссии становится уничтожение вражеских целей. На некоторых уровнях будут присутствовать напарники или союзные войска, что будут самостоятельно совершать ходы и оказывать поддержку пользователю. Одиночная кампания состоит из постепенно усложняющихся операций, где приходится устранять противников на поле боя. Между схватками получится посетить "виртуальный гараж", где можно установить разблокированные компоненты и улучшить военную мощь героев и их роботизированной техники. Сюжетная линия показывает 2112 год, где геймеры проследят за приключениями японца Кадзуки Такэмуро и его товарища Рёго Кусамо, что работают в Кирисима Индастриз и вынуждены отправиться на секретный участок около города Йокосука.