В мире Ninja Noboken юзеры берут под контроль ловкого ниндзя, что вынужден сопротивляться разнообразным противникам и преодолевать ландшафтные препятствия. Игра является псевдотрехмерным платформером, где необходимо продвигаться по локациям с видом сбоку, сражаться с врагами и перепрыгивать через разные преграды на карте. Проект сделан в стилистике 8-битных экшен-адвенчур, где придется часто вступать в драки с соперниками. Во время приключений в Ниндзя Нобокен, юзерам приходится сталкиваться с различными испытаниями. Также выйдет отслеживать за сюжетным повествованием, наполненным предательством и неожиданными поворотами.

Игроки будут пробираться через локации замка, чтобы уничтожить босса и спасти человечество от полного опустошения. Нобокен является первоклассным бойцом, что полагается на акробатические трюки и ловкие боевые стили и техники, помогающие в бою. Также пользователи смогут применять заклинания, что будут повышать атакующие или защитные характеристики персонажа. Игра рассчитана на любителей хардкорных испытаний, где у юзеров получится проверить собственную скорость реакции. В сражениях нужно просчитывать тайминги и наносить удары по врагам, чтобы расчищать себе путь. Главной задачей становится уничтожение босса, пройдя через постепенно усложняющиеся и комплексные уровни в одиночной кампании.