События Commandos: Behind Enemy Lines разворачиваются во времена Второй мировой войны, а вы контролируете отрядом диверсантов. Пройдите через 20 хардкорных уровней, где предстоит выполнять определенные задания. Вид происходит сверху, а на обширных локациях потребуется уничтожать вражеские объекты или технику, вызволять союзников из плена или устранять группенфюреров. В вашей группировке максимально 6 персонажей со своими способностями, но в определенных миссиях разрешено брать только часть из них.

Подопечные способны управлять такой техникой: бронеавтомобилями, обычными машинами, танками Panzer или небольшой подводной лодкой. Побывайте в Северной Африке и Норвегии, где будете выполнять секретные миссии, добывать ценные сведения или устранять важные личности в стане врага. Уровни всегда усложнены, поскольку соперники обладают численным преимуществом, но благодаря смекалке и правильно выстроенной тактике, вы добьетесь успеха.

Если 1 герой из отряда погибает, то миссия заканчивается. В некоторых моментах даже обнаружение подопечных приведет к провалу, а цели и задания перед прохождением уровня всегда высвечиваются в списке. Здесь вы возьмете управление над сапером, шофером, шпионом, морским пехотинцем и десантником. Каждый из них обладает оригинальными возможностями и полезными навыками. Они имеют определенное оружие: пистолеты, снайперскую винтовку, гранаты, автоматы, капканы, шприцы с ядом и прочее. На пути можно освободить пленника, осведомителя или летчика, а немецкие солдаты совершают динамические действия и обладают ограниченным полем зрения.