Мрачное киберпанковое будущее наступило в Ghostrunner. Здесь остатки человечества обитают в городе-башне Дхарме, ставшем их последним пристанищем. Люди разделены на касты при помощи разных имплантов. Хаос, бедность, нехватка продовольствия и преступность воцарились в городе, зато высшие слои общества процветают и отбирают у остальных все ресурсы. Это становиться причиной организации восстания, в котором принимает участие герой.

Исследование мира происходит с целью узнать секрет происхождения протагониста. Для этого предстоит найти Ключницу, управляющую мегаполисом. Мара безжалостная и не жалеет людей, столкнувшихся с бедностью. Главная задача состоит в том, чтобы добраться до вершины города-башни, где обитает Мара, чтобы ее победить. По пути персонаж встретит много сторонников правительницы, с которыми предстоит вступить в схватку.

В экшене сражения осуществляются в мире физическом и в киберпространстве с использованием разного вооружения и оружия ближнего боя. Протагонист стал лучшим мечником тех времен и сражается с врагами при помощи мономолекулярной катаны. Отработанные рефлексы, смертельная техника боя, умение уклоняться от пуль противника - сильные стороны героя. Битвы проходят динамично, и один удар может стать смертельным для персонажа или его врага.