Действия Run Build Pew! происходят в научно-фантастическом сеттинге далеко будущего – в глубоком космосе. А главным героем выступает некий авантюрист и искатель приключений, который натворил дел, из-за чего его теперь ищут все охотники за головами и наемники, желающие сорвать солидный куш за его голову. К счастью, у протагониста есть какой-никакой космический корабль, на котором он пытается убежать в дальний уголок галактики, где его не достанут многочисленные враги.

Но добиться успеха в Run Build Pew! не так просто, ведь чтобы добраться до мирного уголка придеться осилить не один десяток световых лет и пролететь массу галактик. Все это время нужно бесконечно отбиваться от кучи мобов. Если с рядовыми противниками на самом старте проблем возникнуть не должно, то уже ближе к средине надо попотеть, ведь боссы встречаются на пути все чаще, а они имеют много очков здоровья и очень неприятный для пользователя урон.

За убийство соперников юзер получает драгоценную внутриигровую валюту, за которых можно осуществлять прокачку корабля. В самом начале геймер колесит на небольшой платформе с маленьким орудием. Получая все больше ресурсов, их разумно тратить на новые платформы, блоки, модули и вооружение. Таким образом, практически беззащитную и уязвимую посудину не трудно превратить в крупный дредноут, способный выдержать любую атаку.