Samurai Riot предлагает сыграть за одного из двух героев, которые являются бойцами местного тирана. После ядерной катастрофы Япония откатилась в развитии до средневековья, снова вернулась рабовладельческая система. Простые крестьяне находятся под гнетом местной власти, устраивают бунты и именно это непослушание придется усмирить главгероям.

Геймер может выбрать одного из персонажей:

• Тсурумару. Этот мужчина является потомственны самураем и весьма известным во многих кругах благодаря тому, что раньше принимал участие в клане Чести. Помимо сабли, перс любит использовать гранаты, которыми он с легкостью подрывает противников, превращая их тела в пепел;
  
• Сукане. Девушка всегда носит маску, которая закрывает часть ее лица. Ниндзя помимо первоклассных боевых навыков и железной руки, обладает верной спутницей лисицей по кличке Азу. Существо помогает героине в бою, и, как ходят слухи, пришла из потустороннего мира.

На протяжении всей игры будут предоставляться спорные моменты, в которых нужно принять тяжелое решение. Именно из того, что выберет геймер и будет следовать дальнейшее развитие сюжета. Помимо этого, разработчики позаботились, создав 8 противоречивых концовок. Примечательно то, что, если проходить Samurai Riot вдвоем и выбор геймеров будет отличаться друг от друга, придется сразиться, чтобы решить, чье же слово будет окончательным.

В игре присутствует небольшая отсылка к японской мифологии, а состоит она в том, что в нее добавлены маленькие енотообразные существа тануки. Эти чудики будут находиться на всех локациях и, как в древних поверьях, подарят геймеру при нахождении счастье в виде бонусных монеток и других фишек для прокачки амуниции самураев.